Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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