Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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