Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC130448.1-201ENST00000624179 1733 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SUZ12P1-207ENST00000583950 741 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL132996.1-201ENST00000569865 1431 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN4PQ13434 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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