Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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