Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSPL2Q05D32 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms