Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KLF3P57682 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms