Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XPAP23025 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XPAP23025 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XPAP23025 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms