Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCKDHBP21953 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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