Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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