Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN8O00124 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms