Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC78A2IDD5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms