Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM2AQ9Y2K7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms