Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO28Q9NVF7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms