Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPHK2Q9NRA0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms