Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC12Q8WUD4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms