Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4L3Q6VB84 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms