Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms