Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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