Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTAN1Q13813 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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