Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM28Q13263 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM28Q13263 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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