Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF5Q13243 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF5Q13243 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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