Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1AQ13111 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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