Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms