Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms