Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDKL1Q00532 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms