Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDK3Q00526 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms