Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGDP52209 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGDP52209 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PGDP52209 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGDP52209 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms