Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5CP41229 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms