Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD12P35452 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms