Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms