Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GCSHP23434 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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GCSHP23434 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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GCSHP23434 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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GCSHP23434 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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GCSHP23434 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GCSHP23434 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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