Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CPA4Q9UI42 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms