Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLKQ9UBT6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLKQ9UBT6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms