Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GDE1Q9NZC3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1143.4 ms