Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLMPQ9H6B4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms