Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FYCO1Q9BQS8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FYCO1Q9BQS8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms