Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH4Q99466 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NOTCH4Q99466 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms