Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-CQ95604 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms