Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFRP1Q8N474 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms