Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms