Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GREB1Q4ZG55 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms