Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF1Q3BBV0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms