Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPRHQ149N8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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