Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHAF1AQ13111 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms