Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HSPB3Q12988 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms