Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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