Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREMQ03060 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREMQ03060 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms