Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D1P54289 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA2D1P54289 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms