Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THOP1P52888 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms