Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms